Dans le cadre de la Journée scientifique PROTEO-Laval aura lieu la conférence de Kimberley Reynolds, de l'UT Southwestern au Texas. Venez y assister en grand nombre!
Où?: Grand Salon, local 2244 du pavillon Maurice-Pollack
Quand?: Lundi 16 décembre à 14h30
Description : The Genetic Landscape of a Biochemical Interaction
Les protéines individuelles peuvent être exprimées, purifiées et caractérisées de manière exquise en termes de paramètres biochimiques et biophysiques in vitro. Cependant, la relation quantitative entre ces paramètres et des phénotypes complexes tels que la croissance reste mystérieuse. Par exemple, quelles valeurs d'abondance protéique, de stabilité thermique (ΔGfold) et d'activité catalytique (kcat, Km) une enzyme doit-elle atteindre pour maintenir le flux de la voie métabolique et soutenir la croissance cellulaire ? Dans de nombreux cas, il nous manque même des ordres de grandeur sur ces paramètres biochimiques fondamentaux - nous ne savons pas quelles sont les propriétés des protéines qui doivent être réglées avec précision et quelles sont celles qui sont robustes aux variations. Pour combler cette lacune, mon laboratoire cherche à quantifier les contraintes intracellulaires sur l'abondance, l'activité, la régulation et, en fin de compte, la séquence des protéines. Nous utilisons ensuite ces informations pour concevoir de nouveaux systèmes protéiques et construire des modèles mathématiques reliant l'activité et la séquence des protéines au phénotype. Dans cet exposé, je parlerai de notre récente étude sur la façon dont la variation de l'activité d'une enzyme contraint les paramètres biochimiques et la séquence d'une autre enzyme. En combinant l'analyse profonde des mutations et la modélisation mathématique, nous avons montré que le couplage biochimique inter-enzymes peut fortement remodeler la sensibilité d'une enzyme à la mutation. Nos données fournissent une vue d'ensemble des contraintes de séquence dans une paire d'enzymes liées sur le plan biochimique et ouvrent la voie à des mesures à haut débit des paramètres biochimiques des enzymes à l'aide d'essais basés sur la croissance.